微生物，可以被定义为所有占据特定位置的细菌、真菌、原生动物和病毒。在水产养殖中，微生物可以是池塘底部的沉淀物，也可以是动物的整体或部分，比如:肠道器官。目前正在进行大量研究，探索微生物在人类和动物(包括鱼和虾)健康方面的应用。
一、微生物学界的导师
在安东尼·范·列文虎克(Antonie van Leeuwenhoek) 之前，微生物学界真的是不存在的，因为他在17世纪后半叶发明了第一台实用显微镜，并且他在1674年关于单细胞生物发现的开创性工作奠定了基础。所以他被一致认为微生物学之父。
直到161年前的1860年，路易·巴斯德(Louis Pasteur）法国化学家和微生物学家，他发现了疫苗接种、微生物发酵和巴氏杀菌的原理)发明了人工培养基，被分离出来的细菌才得以在上面生长。直到1928年，亚历山大·弗莱明(苏格兰医生和微生物学家)发现了第一种真正的抗生素，他将其命名为青霉素，微生物学才开始迅猛发展。
当时研究的重点是，通过观察细菌在琼脂平板上生长的能力，来分离、识别细菌。而且大多数微生物学家认为，这种方法将揭示微生物生长的复杂性。乔舒亚·莱德伯格（美国分子生物学家），因其在微生物遗传学、人工智能和美国太空计划方面的工作而受到表彰。同时，人们普遍认为，他在2001年创造了“微生物组”(microbiome)这个词，但是这个词首次被使用是在几十年前。然而，之前它的定义非常有限。分子生物学和生物化学的最新进展，使人们真正认识到微生物组的概念是多么复杂。
二、微生物群落是复杂，且不断变化的
我们现在知道，通过培养，我们只能分离出微生物中的很小一部分。绝大多数的细菌还不能培养进行分离。因为它们的生长要求是严格的，我们只知道它们的存在是由于它们的核糖核酸(RNA)[在基因的编码、解码、调控和表达中发挥各种生物学作用的核酸]。科学发现，每个微生物群都是巨大的，我们不知道大多数微生物的作用是什么，也不知道它们可能是什么物种。我们只能经过实验，看看在特定的环境中给特定的动物带来了什么，从这些实验中，我们得出了一些的结论。
微生物群不是恒定的。它在不断地变化和发展。影响这一点的一些因素可以从逻辑上推断出来。可靠的、精心设计的、以科学为基础的实验可以推断出结论。然而，在大多数情况下，我们对正在发生的事情知之甚少。就像许多其他种类的科学一样，人们对科学的理解也在不断变化。
我们可以高度肯定地说，微生物群是极其复杂和高度可变的。而调整的某些方面可能导致微生物出现某些变化。因此，目前现实情况是,，我们不知道99.99%的细菌是什么，它们的作用是什么，它们的数量是如何随着环境和其他因素的变化而变化的。
在实验中，我们在微生物群中加入一些细菌时，我们可以观察到微生物群变化，但这通常在现实环境中是不可能观察的到。在实验室的条件下是一种情况，在现实环境是另外一种情况，是完全有可能的。因此，在我看来，关于微生物群落及其潜在的管理中，我们还有很多东西要学习。
三、微生物在水产养殖上的应用
在水产养殖中，在能够操纵水产养殖系统的环境方面，就能控制好水产养殖。但是，这些环境有很多，如：孵化场、标粗场、RAS系统、生物絮团和其他环境，且每个环境都由许多不同的小环境境组成。经常有人认为，我们将能够控制这些环境中的细菌组成（微生物群落），就能扩大养殖产业、疾病将成为过去，水产养殖业将迎来一个新时代。
我认为，往好了说，这是伪科学，往坏了说，这是将一个已经满面疮痍的水产领域，挖了一个更大的坑。现实当中，很多药品厂家都宣称自家的产品，能够对鱼虾产生直接影响，从而改善动物的健康，但是很根本解释不了为什么是这样。
也许在水产养殖中，微生物被最广泛误解的方面是，相关性不是因果关系。将微生物混合物的使用与其对动物影响的观察结果联系起来，这就是相关性。由于不理解似是而非的机制和与现实世界不一致的实验参数，认为相关性意味着因果关系，既不符合逻辑，也不符合科学。在实验室得出理论验证，不等同于现实当中实际情况，更何况微生物是一种“善变”的生物。
我可以肯定的是，水产养殖业将会看到越来越多关于微生物的产品，这些产品声称：能够改变微生物群，有利于养殖鱼虾。并且，这样的研究观点正在急剧增加。但是大家可能都忘了，不同环境对微生物群的影响都是不可预料的。
世界上没有灵丹妙药！水生动物爆发疾病是因为:压力源、生物安全差，以及对环境对动物健康造成影响等因素的结果。特别在养殖环境中，有许多变量在起作用，因此，我们应该知道，声称某一特定方法将永久改变某一特定微生物群，以确保更好的动物健康，这是不现实的。
四、观点与看法
不幸的是，我这么说可能很多人都不相信。我曾经和许多国家的养殖户一起工作，我看到那些几乎没有接受过正规教育的养殖户，希望有一种持续成功养殖方法，可以给他们带来的巨大回报。我也看到销售人员经常接近他们，向他们提供产品以解决他们的“问题”。
最典型的例子就是“益生菌”一词的使用，这并不意味着任何细菌都可以在任何动物身上，以任何方式使用。由于对微生物群有积极的影响，使用口服的细菌与改善动物健康之间的联系，充其量是相互关联的，并非因果关系。
因此，如果你希望使用单一微生物或者复合微生物，能够一直以改变微生物群的方式，来改善动物健康，这是不现实的期望。
来源：一号水产
